肺功能變化的鑑定與量化：
肺功能檢查最常用的目的是偵測肺部疾病，更者可以定量疾病的進展或可逆性。

肺部疾病的流行病學檢查：
篩檢可以偵測一般國民、職業場所、吸菸者或其他高危險群因疾病或環境因子引起的肺不正常。同時，有些研究者藉由國民的平均肺功能來決定肺功能的正常值。

評估手術後肺部合併症的危險性：
手術前的檢查可以鑑別出有那些病患在手術後會增加肺部合併症的危險。有時候，可藉由手術前的呼吸照護來降低合併症的危險性。

幫助決定肺的殘疾(disability)：
肺功能檢查也可以決定因肺疾病引起的殘疾程度，包括職業病如煤礦工的矽肺症(pneumoconiosis)。

治療有效性的評估及量化：
肺功能檢查可以協助醫師選擇或修正特別的治療方法或技術(如支氣管擴張劑的療效，復健運動的療程)。醫師及研究者利用肺功能檢查來觀察治療前後測量的肺功能變化。