本院大腸直腸外科最初設至於一般外科內，西元1994年∼1997年本院陸續設立專科，初設立命名為「結、直腸及肛門外科」，後更名為大眾熟悉的「大腸直腸外科」。

    本科由外科部部長陳壽星、大腸直腸外科主任吳喬森領軍，科內醫師技術熟稔、成效卓越，多年來致力於大腸直腸癌的手術與治療，為大腸直腸癌手術與治療之中部後送醫院。同時發展最新微創腹腔鏡手術及推廣肛門保存手術。

    對中、低位直腸癌之治療方面，本科與放射科、核醫科、腫瘤科、血液腫瘤科等，跨科部全力合作，建構腸癌全方位之診斷與治療。手術前新輔助之放射治療及化學治療，使腫瘤消除，甚至有病人腫瘤完全消失，並在治療中盡量得以保留肛門，避免肛門切除，避免病人受永久人工肛門之苦，提升病患術後的生活品質。