兒科為中部海線地區最完整之次專科醫師陣容團隊，設有：新生兒科、兒童神經科、兒童胸腔科、兒童腸胃科、兒童感染科、兒童過敏氣喘免疫風濕科、兒童心臟科、兒童急救加護、兒童重症等。科內擁有最齊全的高科技儀器如：小兒腦波、呼吸器、彩色超音波、心臟超音波、各種神經電位檢查儀器、小兒胃鏡，大腸鏡檢查等。結合兒童加護病房，提供海線兒科最佳的醫療 服務。

   新生兒科結合婦產科高危險妊娠，提供完善的新生兒照護，主治新生兒常見疾病包括早產兒的處置及後續追蹤 、新生兒呼吸、消化、泌尿、神經循環等疾病。

   兒童神經專科是本科特色之一，主治兒童癲癇、腦膜腦炎、小兒先天性代謝性疾病、兒童發育遲緩之語言、動作、學習能力障礙和早期療育等病症患者。

   此外，本院結合了兒科醫師及其他相關專科醫師、復健治療師、語言治療師、心理師與社工師等專業人員，為發展遲緩兒童早期療育進行評估，秉持著盡心、用心、細心的服務精神，提供最健全的醫療服務。本科開辦之「健兒門診」藉由受過專業訓練的醫護人員，仔細的進行身體健康檢查及衛教宣導，提供高品質的醫療及完整 的疫苗注射服務。同時，值得一提的是，本院還同時榮獲周產期學會選定為「周產期緊急醫療後送醫院」，提供後(轉)送來本院的病嬰及早產兒妥善且即時的醫療服務。