光學顯微鏡

本感染管制室設有一台光學顯微鏡，便於快速細菌染色(革藍氏細菌及結核菌)及判定，以利於臨床抗生素治療之選擇。一台專門冷凍庫，可供採檢的菌種保存。

感染管制團隊

兩院區各有一感染管制室，沙鹿總院編制有專責感染管制師三位(其中一位兼任愛滋病個管師)，結核個管師一位，大甲分院編制有專責感染管制師二位(其中一位兼任愛滋病個管師)，結核個管師一位。兩院區共有一位專責感染管制醫檢師，負責兩院區定期菌種監測及疫情監測等業務。

檢驗科細菌室

各式微生物培養及鑑定設備。